Johanna Hynninen

Evolutionary states and trajectories characterized by distinct pathways stratify patients with ovarian high grade serous carcinoma (2023)

Cancer Cell

Lahtinen Alexandra, Lavikka Kari, Virtanen Anni, Li Yilin, Jamalzadeh Sanaz, Skorda Aikaterini, Lauridsen Anna Rössberg, Zhang Kaiynag, Marchi Giovanni, Isoviita Veli-Matti, Ariotta Valeria, Lehtonen Oskari, Muranen Taru A., Huhtinen Kaisa, Carpén Olli, Hietanen Sakari, Senkowski Wojciech, Kallunki Tuula, Häkkinen Aantti, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Quantification of cell death and proliferation of patient-derived ovarian cancer organoids through 3D imaging and image analysis (2023)

STAR protocols

Skorda Aikaterini, Lauridsen Anna Rossberg, Huhtinen Kaisa, Lahtinen Alexandra, Senkowski Wojciech, Oikkonen Jaana, Hynninen Johanna, Hautaniemi Sampsa, Kallunki Tuula

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Circulating tumor DNA-based copy-number profiles enable monitoring treatment effects during therapy in high-grade serous carcinoma (2023)

Biomedicine and Pharmacotherapy

Nguyen Mai TN, Rajavuori Anna, Huhtinen Kaisa, Hietanen Sakari, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Effects of Wee1 inhibitor adavosertib on patient-derived high-grade serous ovarian cancer cells are multiple and independent of homologous recombination status (2022)

Frontiers in Oncology

Roering Pia, Siddiqui Arafat, Heuser Vanina D, Potdar Swapnil, Mikkonen Pia, Oikkonen Jaana, Li Yilin, Pikkusaari Sanna, Wennerberg Krister, Hynninen Johanna, Grenman Seija, Huhtinen Kaisa, Auranen Annika, Carpén Olli, Kaipio Katja

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability (2022)

Laboratory Investigation

Jamalzadeh Sanaz, Häkkinen Antti, Andersson Noora, Huhtinen Kaisa, Laury Anna, Hietanen Sakari, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Carpén Olli, Virtanen Anni, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Subset of Secreted Proteins in Ascites Can Predict Platinum-Free Interval in Ovarian Cancer (2022)

Cancers

Carroll Molly J, Kaipio Katja, Hynninen Johanna, Carpen Olli, Hautaniemi Sampsa, Page David, Kreeger Pamela K

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer (2022)

Science Advances

Zhang Kaiyang, Erkan Erdogan Pekcan, Jamalzadeh Sanaz, Dai Jun, Andersson Noora, Kaipio Katja, Lamminen Tarja, Mansuri Naziha, Huhtinen Kaisa, Carpén Olli, Hietanen Sakari, Oikkonen Jaana, Hynninen Johanna, Virtanen Anni, Häkkinen Antti, Hautaniemi Sampsa, Vähärautio Anna

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Optimized detection of homologous recombination deficiency improves the prediction of clinical outcomes in cancer (2022)

npj Precision Oncology

Perez-Villatoro F, Oikkonen J, Casado J, Chernenko A, Gulhan DC, Tumiati M, Li YL, Lavikka K, Hietanen S, Hynninen J, Haltia UM, Tyrmi JS, Laivuori H, Konstantinopoulos PA, Hautaniemi S, Kauppi L, Farkkila A

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Agile Workflow For Interactive Analysis Of Mass Cytometry Data (2021)

Bioinformatics

Casado J, Lehtonen O, Rantanen V, Kaipio K, Pasquini L, Häkkinen A, Petrucci E, Hynninen J, Hietanen S, Carpén O, Biffoni M, Färkkilä A, Hautaniemi S

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Syöpäsolujen lääkeresistenssi ja miten se voitetaan - valokeilassa munasarjasyöpä (2021)

Duodecim

Hautaniemi Sampsa, Hynninen Johanna

(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))

Contact

Links

Areas of expertise

Publications

Sort by:

Evolutionary states and trajectories characterized by distinct pathways stratify patients with ovarian high grade serous carcinoma (2023)

Quantification of cell death and proliferation of patient-derived ovarian cancer organoids through 3D imaging and image analysis (2023)

Circulating tumor DNA-based copy-number profiles enable monitoring treatment effects during therapy in high-grade serous carcinoma (2023)

Effects of Wee1 inhibitor adavosertib on patient-derived high-grade serous ovarian cancer cells are multiple and independent of homologous recombination status (2022)

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability (2022)

A Subset of Secreted Proteins in Ascites Can Predict Platinum-Free Interval in Ovarian Cancer (2022)

Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer (2022)

Optimized detection of homologous recombination deficiency improves the prediction of clinical outcomes in cancer (2022)

Agile Workflow For Interactive Analysis Of Mass Cytometry Data (2021)

Syöpäsolujen lääkeresistenssi ja miten se voitetaan - valokeilassa munasarjasyöpä (2021)