Manu
Tamminen
Docent, Department of Biology
Academy Research Fellow, Physiology and Genetics
PhD, Docent
Contact
Areas of expertise
Molecular biology
Bioinformatics
Microbial Genetics
Microbial Ecology
Biography
- MSc, University of Turku, 2002
- PhD, University of Helsinki, 2011
- Post-doc, MIT, 2011-2013
- Post-doc, ETH Zürich, 2014-2017
- Adjunct professor, University of Turku, 2017
- Senior lecturer, University of Turku, 2017-
Teaching
- SOMO1021 - Advanced genetics (2018)
- FYGE2242 - Laboratory course of microbial genetics (2018)
- BIOL1301 - Fundamentals of genetics (2018)
- FYGE 4031 - Laboratory methods in genetics (2018)
- BIOL3050 - Bioinformatics for biologists (2019)
- BIOL3200 - BSc seminars (2019)
- BIOL1301 - Fundamentals of genetics (2019)
- FYGE 4031 - Laboratory methods in genetics (2019)
Research
- Single cell genomics of bacteria and small eukaryotes
- Horizontal transfer of antibiotic resistance genes
- Quantitative applications of NGS
Publications
Stream microbial communities and ecosystem functioning show complex responses to multiple stressors in wastewater (2020)
Global Change Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Digital multiplex ligation assay for highly multiplexed screening of beta-lactamase-encoding genes in bacterial isolates (2020)
Communications Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Uncovering microbial inter-domain interactions in complex communities (2019)
Philosophical Transactions B: Biological Sciences
(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))
Occurrence of sul and tet(M) genes in bacterial community in Japanese marine aquaculture environment throughout the year: Profile comparison with Taiwanese and Finnish aquaculture waters (2019)
Science of the Total Environment
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Proteome evolution under non-substitutable resource limitation (vol 9, 4650, 2018) (2019)
Nature Communications
(Muu (O2))
Construction and Characterization of Synthetic Bacterial Community for Experimental Ecology and Evolution (2018)
Frontiers in Genetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Ecology determines how low antibiotic concentration impacts community composition and horizontal transfer of resistance genes (2018)
Communications Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Archaea are prominent members of the prokaryotic communities colonizing common forest mushrooms (2018)
Canadian Journal of Microbiology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Proteome evolution under non-substitutable resource limitation (2018)
Nature Communications
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Host range of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant influent and effluent (2018)
FEMS Microbiology Ecology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))