Pekka Ruusuvuori

Virtual staining for histology by deep learning (2024)

Trends in Biotechnology

Latonen Leena, Koivukoski Sonja, Khan Umair, Ruusuvuori Pekka

(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))

Platinum-based drugs induce phenotypic alterations in nucleoli and Cajal bodies in prostate cancer cells (2024)

Cancer Cell International

Batnasan Enkhzaya, Kärkkäinen Minttu, Koivukoski Sonja, Sadeesh Nithin, Tollis Sylvain, Ruusuvuori Pekka, Scaravilli Mauro, Latonen Leena

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Unstained Tissue Imaging and Virtual Hematoxylin and Eosin Staining of Histologic Whole Slide Images (2023)

Laboratory Investigation

Koivukoski Sonja, Khan Umair, Ruusuvuori Pekka, Latonen Leena

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Deep learning transforms colorectal cancer biomarker prediction from histopathology images (2023)

Cancer Cell

Ruusuvuori Pekka, Valkonen Mira, Latonen Leena

(Kirjoitus tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (B1))

Deformation equivariant cross-modality image synthesis with paired non-aligned training data (2023)

Medical Image Analysis

Honkamaa Joel, Khan Umair, Koivukoski Sonja, Valkonen Mira, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka, Marttinen Pekka

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Genomic characterization of IDH-mutant astrocytoma progression to grade 4 in the treatment setting (2023)

Acta Neuropathologica Communications

Rautajoki Kirsi, Jaatinen Serafiina, Hartewig Anja, Tiihonen Aliisa, Annala Matti, Salonen Iida, Valkonen Masi, Simola Vili, Vuorinen Elisa M., Kivinen Anni, Rauhala Minna, Nurminen Riikka, Maass Kendra, Lahtela Sirpa-Liisa, Jukkola Arja, Yli-Harja Olli, Helen Pauli, Pajtler Kristian, Ruusuvuori Pekka, Haapasalo Joonas, Zhang Wei, Haapasalo Hannu, Nykter Matti

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

The effect of neural network architecture on virtual H&E staining: Systematic assessment of histological feasibility (2023)

Patterns

Khan Umair, Koivukoski Sonja, Valkonen Mira, Latonen Leena, Ruusuvuori Pekka

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Domain-specific transfer learning in the automated scoring of tumor-stroma ratio from histopathological images of colorectal cancer (2023)

PLoS ONE

Petäinen Liisa, Väyrynen Juha P., Ruusuvuori Pekka, Pölönen Ilkka, Äyrämö Sami, Kuopio Teijo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Interobserver reproducibility of cribriform cancer in prostate needle biopsies and validation of International Society of Urological Pathology criteria (2023)

Histopathology

Egevad L, Delahunt B, Iczkowski KA, van der Kwast T, van Leenders GJLH, Leite KRM, Pan CC, Samaratunga H, Tsuzuki T, Mulliqi N, Ji XY, Olsson H, Valkonen M, Ruusuvuori P, Eklund M, Kartasalo K

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Multi-Stain Breast Cancer Histological Whole-Slide-Image Data Set from Routine Diagnostics (2023)

Scientific Data

Weitz P, Valkonen M, Solorzano L, Carr C, Kartasalo K, Boissin C, Koivukoski S, Kuusela A, Rasic D, Feng YB, Pouplier SS, Sharma A, Eriksson KL, Latonen L, Laenkholm AV, Hartman J, Ruusuvuori P, Rantalainen M

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Publications

Sort by:

Virtual staining for histology by deep learning (2024)

Platinum-based drugs induce phenotypic alterations in nucleoli and Cajal bodies in prostate cancer cells (2024)

Unstained Tissue Imaging and Virtual Hematoxylin and Eosin Staining of Histologic Whole Slide Images (2023)

Deep learning transforms colorectal cancer biomarker prediction from histopathology images (2023)

Deformation equivariant cross-modality image synthesis with paired non-aligned training data (2023)

Genomic characterization of IDH-mutant astrocytoma progression to grade 4 in the treatment setting (2023)

The effect of neural network architecture on virtual H&E staining: Systematic assessment of histological feasibility (2023)

Domain-specific transfer learning in the automated scoring of tumor-stroma ratio from histopathological images of colorectal cancer (2023)

Interobserver reproducibility of cribriform cancer in prostate needle biopsies and validation of International Society of Urological Pathology criteria (2023)

A Multi-Stain Breast Cancer Histological Whole-Slide-Image Data Set from Routine Diagnostics (2023)