Johanna Hynninen

FUNGI: Fusion Gene Integration Toolset (2021)

Bioinformatics

Cervera Alejandra, Rausio Heidi, Kähkönen Tiia, Andersson Noora, Partel Gabriele, Rantanen Ville, Paciello Giulia, Ficarra Elisa, Hynninen Johanna, Hietanen Sakari, Carpén Olli, Lehtonen Rainer, Hautaniemi Sampsa, Huhtinen Kaisa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Syöpäsolujen lääkeresistenssi ja miten se voitetaan - valokeilassa munasarjasyöpä (2021)

Duodecim

Hautaniemi Sampsa, Hynninen Johanna

(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))

Genetically defined syngeneic mouse models of ovarian cancer as tools for the discovery of combination immunotherapy (2021)

Cancer Discovery

Iyer Sonia, Zhang Shuang, Yucel Simge, Horn Heiko, Smith Sean G, Reinhardt Ferenc, Hoefsmit Esmee, Assatova Bimarzhan, Casado Julia, Meinsohn Marie-Charlotte, Barrasa M Inmaculada, Bell George W, Perez-Villatoro Fernando, Huhtinen Kaisa, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Galhenage Pamoda M, Pathania Shailja, Hammond Paula T, Neel Benjamin G, Färkkilä Anniina, Pépin David, Weinberg Robert A.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Agile Workflow For Interactive Analysis Of Mass Cytometry Data (2021)

Bioinformatics

Casado J, Lehtonen O, Rantanen V, Kaipio K, Pasquini L, Häkkinen A, Petrucci E, Hynninen J, Hietanen S, Carpén O, Biffoni M, Färkkilä A, Hautaniemi S

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

RNA-seq analysis of high-grade serous ovarian cancer patients before and after chemotherapy reveals chemoresistance-associated genes and pathways (2020)

Clinical Cancer Research

Jamalzadeh S, Zhang KY, Hakkinen A, Huhtinen K, Hynninen J, Andersson N, Mansuri N, Carpen O, Erdogan E, Dai J, Vaharautio A, Hietanen S, Oikkonen J, Lehtonen R, Hautaniemi S

(O2 Muu julkaisu )

A longitudinal analysis of CA125 glycoforms in the monitoring and follow up of high grade serous ovarian cancer (2020)

Gynecologic Oncology

Liina Salminen, Nimrah Nadeem, Shruti Jain, Seija Grènman, Olli Carpén, Sakari Hietanen, Sinikka Oksa, Urpo Lamminmäki, Kim Pettersson, Kamlesh Gidwani, Kaisa Huhtinen, Johanna Hynninen

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Analysis of single-cell RNA-seq data from ovarian cancer samples before and after chemotherapy links stress-related transcriptional profile with chemotherapy resistance (2020)

bioRxiv

Zhang K, Erkan EP, Dai J, Andersson N, Kaipio K, Lamminen T, Mansuri N, Huhtinen K, Carpen O, Hynninen J, others

(O2 Muu julkaisu )

Glycovariant-based lateral flow immunoassay to detect ovarian cancer–associated serum CA125 (2020)

Communications Biology

Sherif Bayoumy, Heidi Hyytiä, Janne Leivo, Sheikh M. Talha, Kaisa Huhtinen, Matti Poutanen, Johanna Hynninen, Antti Perheentupa, Urpo Lamminmäki, Kamlesh Gidwani & Kim Pettersson

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Author Correction: Virtual clinical trials identify effective combination therapies in ovarian cancer (2020)

Scientific Reports

Kozłowska E, Vallius T, Hynninen J, Hietanen S, Färkkilä A, Hautaniemi S

(O2 Muu julkaisu )

ALDH1A1-related stemness in high-grade serous ovarian cancer is a negative prognostic indicator but potentially targetable by EGFR/mTOR-PI3K/aurora kinase inhibitors (2020)

Journal of Pathology

Katja Kaipio, Ping Chen, Pia Roering, Kaisa Huhtinen, Piia Mikkonen, Päivi Östling, Laura Lehtinen, Naziha Mansuri, Taina Korpela, Swapnil Potdar, Johanna Hynninen, Annika Auranen, Seija Grénman, Krister Wennerberg, Sampsa Hautaniemi, Olli Carpén

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Ota yhteyttä

Linkit

Julkaisut

Järjestä:

FUNGI: Fusion Gene Integration Toolset (2021)

Syöpäsolujen lääkeresistenssi ja miten se voitetaan - valokeilassa munasarjasyöpä (2021)

Genetically defined syngeneic mouse models of ovarian cancer as tools for the discovery of combination immunotherapy (2021)

Agile Workflow For Interactive Analysis Of Mass Cytometry Data (2021)

RNA-seq analysis of high-grade serous ovarian cancer patients before and after chemotherapy reveals chemoresistance-associated genes and pathways (2020)

A longitudinal analysis of CA125 glycoforms in the monitoring and follow up of high grade serous ovarian cancer (2020)

Analysis of single-cell RNA-seq data from ovarian cancer samples before and after chemotherapy links stress-related transcriptional profile with chemotherapy resistance (2020)

Glycovariant-based lateral flow immunoassay to detect ovarian cancer–associated serum CA125 (2020)

Author Correction: Virtual clinical trials identify effective combination therapies in ovarian cancer (2020)

ALDH1A1-related stemness in high-grade serous ovarian cancer is a negative prognostic indicator but potentially targetable by EGFR/mTOR-PI3K/aurora kinase inhibitors (2020)