Sami Kurkinen

Virtual Screening Strategy to Identify Retinoic Acid-Related Orphan Receptor γt Modulators (2023)

Molecules

Jokinen Elmeri M, Niemeläinen Miika, Kurkinen Sami T, Lehtonen Jukka V, Lätti Sakari, Postila Pekka A, Pentikäinen Olli T, Niinivehmas Sanna P

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Ligand-Enhanced Negative Images Optimized for Docking Rescoring (2022)

International Journal of Molecular Sciences

Kurkinen Sami T, Lehtonen Jukka V, Pentikäinen Olli T, Postila Pekka A

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome (2022)

Photochemical & Photobiological Sciences Photochemical and Photobiological Sciences

Lehtivuori Heli, Rumfeldt Jessica, Mustalahti Satu, Kurkinen Sami, Takala Heikki

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Optimization of Cavity-Based Negative Images to Boost Docking Enrichment in Virtual Screening (2022)

Journal of Chemical Information and Modeling

Kurkinen Sami T., Lehtonen Jukka V., Pentikäinen Olli T., Postila Pekka A.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Negative Image-Based Screening: Rigid Docking Using Cavity Information (2021)

Postila Pekka A., Kurkinen Sami T., Pentikäinen Olli T.

(Vertaisarvioitu artikkeli kokoomateoksessa (A3))

Detection of binding sites on SARS-CoV-2 Spike protein receptor-binding domain by molecular dynamics simulations in mixed solvents (2021)

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

Jokinen Elmeri M., Gopinath Krishnasamy, Kurkinen Sami T., Pentikäinen Olli T.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Screening of Natural Products Targeting SARS-CoV-2-ACE2 Receptor Interface - A MixMD Based HTVS Pipeline (2020)

Frontiers in Chemistry

Krishnasamy Gopinath, Elmeri M. Jokinen, Sami T. Kurkinen, Olli T. Pentikäinen

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Inhibition of Pneumolysin Cytotoxicity by Hydrolysable Tannins (2020)

Antibiotics

Santeri Maatsola, Sami Kurkinen, Marica T. Engström, Thomas K. M. Nyholm, Olli Pentikäinen, Juha-Pekka Salminen, Sauli Haataja

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Practical Perspective: The Effect of Ligand Conformers on the Negative Image-Based Screening (2019)

International Journal of Molecular Sciences

Ahinko M, Kurkinen ST, Niinivehmas SP, Pentikäinen OT, Postila PA

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Getting Docking into Shape Using Negative Image-Based Restoring (2019)

Journal of Chemical Information and Modeling

Sami T. Kurkinen, Sakari Lätti, Olli T. Pentikäinen, Pekka A. Postila

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Ota yhteyttä

Julkaisut

Järjestä:

Virtual Screening Strategy to Identify Retinoic Acid-Related Orphan Receptor γt Modulators (2023)

Ligand-Enhanced Negative Images Optimized for Docking Rescoring (2022)

Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome (2022)

Optimization of Cavity-Based Negative Images to Boost Docking Enrichment in Virtual Screening (2022)

Negative Image-Based Screening: Rigid Docking Using Cavity Information (2021)

Detection of binding sites on SARS-CoV-2 Spike protein receptor-binding domain by molecular dynamics simulations in mixed solvents (2021)

Screening of Natural Products Targeting SARS-CoV-2-ACE2 Receptor Interface - A MixMD Based HTVS Pipeline (2020)

Inhibition of Pneumolysin Cytotoxicity by Hydrolysable Tannins (2020)

A Practical Perspective: The Effect of Ligand Conformers on the Negative Image-Based Screening (2019)

Getting Docking into Shape Using Negative Image-Based Restoring (2019)