Sini
Junttila
tutkijatohtori, Turun biotiedekeskus
Julkaisut
ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data (2021)
Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
scShaper: an ensemble method for fast and accurate linear trajectory inference from single-cell RNA-seq data (2021)
Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Differential ATAC-seq and ChIP-seq peak detection using ROTS (2021)
NAR Genomics and Bioinformatics: Nucleic Acids Research Genomics and Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Reproducibility-optimized detection of differential DNA methylation (2020)
Epigenomics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Leptin and fractalkine: novel subcutaneous cytokines in burn injury (2020)
Disease Models and Mechanisms
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Characterisation of Cladonia rangiferina transcriptome and genome, and the effects of dehydration and rehydration on its gene expression (2016)
(Artikkeliväitöskirja (G5))Retene causes multifunctional transcriptomic changes in the heart of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) embryos (2016)
Environmental Toxicology and Pharmacology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Differential Promoter Methylation of Macrophage Genes Is Associated With Impaired Vascular Growth in Ischemic Muscles of Hyperlipidemic and Type 2 Diabetic Mice Genome-Wide Promoter Methylation Study (2015)
Circulation Research
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
IRF4 Deficiency Leads to Altered BCR Signalling Revealed by Enhanced PI3K Pathway, Decreased SHIP Expression and Defected Cytoskeletal Responses (2015)
Scandinavian Journal of Immunology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Whole transcriptome characterization of the effects of dehydration and rehydration on Cladonia rangiferina, the grey reindeer lichen (2013)
BMC Genomics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))