Bishwa Ghimire

Nextpie: a web-based reporting tool and database for reproducible nextflow pipelines (2025)

Bioinformatics Advances

Ghimire, Bishwa; Booth, Nicholas; Lönnberg, Tapio; Aittokallio, Tero

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

COVID-19 vaccine type controls stromal reprogramming in draining lymph nodes (2025)

Science Immunology

Fair-Mäkelä, Ruth; Thorén, Pinja; Näsiaho, Joni; Sundqvist, Pia; Piiroinen, Irina; Kähäri, Laura; Julkunen, Ilkka; Ivaska, Johanna; Hub, Elin; Rot, Antal; Ghimire, Bishwa; Alanko, Jonna; Salmi, Marko

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

α-Melanocyte-stimulating hormone alleviates pathological cardiac remodeling via melanocortin 5 receptor (2024)

EMBO Reports

Suominen Anni, Saldo Rubio Guillem, Ruohonen Saku, Szabó Zoltan, Pohjolainen Lotta, Ghimire Bishwa, Ruohonen Suvi T., Saukkonen Karla, Ijas Jani, Skarp Sini, Kaikkonen Leena, Cai Minying, Wardlaw Sharon L., Ruskoaho Heikki, Talman Virpi, Savontaus Eriika, Kerkelä Risto, Rinne Petteri

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Oxidative Stress and Inflammation-Related mRNAs Are Elevated in Serum of a Finnish Wet AMD Cohort (2024)

Investigative Ophthalmology & Visual Science

Liukkonen, Mikko; Heloterä, Hanna; Siintamo, Leea; Ghimire, Bishwa; Mattila, Pirkko; Kivinen, Niko; Kostanek, Joanna; Watala, Cezary; Hytti, Maria; Hyttinen, Juha; Koskela, Ali; Blasiak, Janusz; Kaarniranta, Kai

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications (2024)

Angiogenesis

Majid Qasim A., Ghimire Bishwa R., Merkely Bela, Randi Anna M., Harding Sian E., Talman Virpi, Földes Gabor

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Hepatocyte-specific loss of melanocortin 1 receptor disturbs fatty acid metabolism and promotes adipocyte hypertrophy (2024)

International Journal of Obesity

Thapa, Keshav; Ghimire, Bishwa; Pokharel, Kisun; Cai, Minying; Savontaus, Eriika; Rinne, Petteri

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Melanocortin 1 receptor regulates cholesterol and bile acid metabolism in the liver (2023)

eLife

Thapa Keshav, Kadiri James J, Saukkonen Karla, Pennanen Iida, Ghimire Bishwa, Cai Minying, Savontaus Eriika, Rinne Petteri

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Plasma cell-free DNA methylation marks for episodic memory impairment: a pilot twin study (2020)

Scientific Reports

M. Konki, N. Lindgren, M. Kyläniemi, R. Venho, E. Laajala, B. Ghimire, R. Lahesmaa, J. Kaprio, J. O. Rinne, R. J. Lund

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Epigenetic Silencing of the Key Antioxidant Enzyme Catalase in Karyotypically Abnormal Human Pluripotent Stem Cells (2016)

Scientific Reports

Konki M, Pasumarthy K, Malonzo M, Sainio A, Valensisi C, Soderstrom M, Emani MR, Stubb A, Narva E, Ghimire B, Laiho A, Jarvelainen H, Lahesmaa R, Lahdesmaki H, Hawkins RD, Lund RJ

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Bishwa

Ghimire

Contact

Publications

Sort by:

Nextpie: a web-based reporting tool and database for reproducible nextflow pipelines (2025)

COVID-19 vaccine type controls stromal reprogramming in draining lymph nodes (2025)

α-Melanocyte-stimulating hormone alleviates pathological cardiac remodeling via melanocortin 5 receptor (2024)

Oxidative Stress and Inflammation-Related mRNAs Are Elevated in Serum of a Finnish Wet AMD Cohort (2024)

Generation and characterisation of scalable and stable human pluripotent stem cell-derived microvascular-like endothelial cells for cardiac applications (2024)

Hepatocyte-specific loss of melanocortin 1 receptor disturbs fatty acid metabolism and promotes adipocyte hypertrophy (2024)

Melanocortin 1 receptor regulates cholesterol and bile acid metabolism in the liver (2023)

Plasma cell-free DNA methylation marks for episodic memory impairment: a pilot twin study (2020)

Epigenetic Silencing of the Key Antioxidant Enzyme Catalase in Karyotypically Abnormal Human Pluripotent Stem Cells (2016)