Johanna Hynninen

Toxicity and therapy outcome associations in LIG3, SLCO1B3, ABCB1, OPRM1 and GSTP1 in high-grade serous ovarian cancer (2023)

Basic and Clinical Pharmacology and Toxicology

Deng Feng, Laasik Maren, Salminen Liina, Lapatto Lauri, Huhtinen Kaisa, Li Yilin, Hautaniemi Sampsa, Hynninen Johanna, Niemi Mikko, Lehtonen Rainer

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

H&E image analysis pipeline for quantifying morphological features (2023)

Journal of Pathology Informatics

Ariotta Valeria, Lehtonen Oskari, Salloum Shams, Micoli Giulia, Lavikka Kari, Rantanen Ville, Hynninen Johanna, Virtanen Anni, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Functional Homologous Recombination Assay on FFPE Specimens of Advanced High-Grade Serous Ovarian Cancer Predicts Clinical Outcomes (2023)

Clinical Cancer Research

Pikkusaari Sanna, Tumiati Manuela, Virtanen Anni, Oikkonen Jaana, Li Yilin, Perez-Villatoro Fernando, Muranen Taru, Salko Matilda, Huhtinen Kaisa, Kanerva Anna, Koskela Heidi, Tapper Johanna, Koivisto-Korander Riitta, Joutsiniemi Titta, Haltia Ulla-Maija, Lassus Heini, Hautaniemi Sampsa, Färkkilä Anniina, Hynninen Johanna, Hietanen Sakari, Carpen Olli, Kauppi Liisa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer (2022)

Science Advances

Zhang Kaiyang, Erkan Erdogan Pekcan, Jamalzadeh Sanaz, Dai Jun, Andersson Noora, Kaipio Katja, Lamminen Tarja, Mansuri Naziha, Huhtinen Kaisa, Carpén Olli, Hietanen Sakari, Oikkonen Jaana, Hynninen Johanna, Virtanen Anni, Häkkinen Antti, Hautaniemi Sampsa, Vähärautio Anna

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Optimized detection of homologous recombination deficiency improves the prediction of clinical outcomes in cancer (2022)

npj Precision Oncology

Perez-Villatoro F, Oikkonen J, Casado J, Chernenko A, Gulhan DC, Tumiati M, Li YL, Lavikka K, Hietanen S, Hynninen J, Haltia UM, Tyrmi JS, Laivuori H, Konstantinopoulos PA, Hautaniemi S, Kauppi L, Farkkila A

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Effects of Wee1 inhibitor adavosertib on patient-derived high-grade serous ovarian cancer cells are multiple and independent of homologous recombination status (2022)

Frontiers in Oncology

Roering Pia, Siddiqui Arafat, Heuser Vanina D, Potdar Swapnil, Mikkonen Pia, Oikkonen Jaana, Li Yilin, Pikkusaari Sanna, Wennerberg Krister, Hynninen Johanna, Grenman Seija, Huhtinen Kaisa, Auranen Annika, Carpén Olli, Kaipio Katja

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability (2022)

Laboratory Investigation

Jamalzadeh Sanaz, Häkkinen Antti, Andersson Noora, Huhtinen Kaisa, Laury Anna, Hietanen Sakari, Hynninen Johanna, Oikkonen Jaana, Carpén Olli, Virtanen Anni, Hautaniemi Sampsa

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A Subset of Secreted Proteins in Ascites Can Predict Platinum-Free Interval in Ovarian Cancer (2022)

Cancers

Carroll Molly J, Kaipio Katja, Hynninen Johanna, Carpen Olli, Hautaniemi Sampsa, Page David, Kreeger Pamela K

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Imaging of Tumor Hypoxia With F-18-EF5 PET/MRI in Cervical Cancer (2021)

Clinical Nuclear Medicine

Narva Sara I., Seppänen Marko P., Raiko Juho R. H., Forsback Sarita J., Orte Katri J., Virtanen Johanna M., Hynninen Johanna, Hietanen Sakari

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Co-evolution of matrisome and adaptive adhesion dynamics drives ovarian cancer chemoresistance (2021)

Nature Communications

Pietilä E.A., Gonzalez-Molina J., Moyano-Galceran L., Jamalzadeh S., Zhang K., Lehtinen L., Turunen S.P., Martins T.A., Gultekin O., Lamminen T., Kaipio K., Joneborg U., Hynninen J., Hietanen S., Grénman S., Lehtonen R., Hautaniemi S., Carpén O., Carlson J.W., Lehti K.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Links

Areas of expertise

Publications

Sort by:

Toxicity and therapy outcome associations in LIG3, SLCO1B3, ABCB1, OPRM1 and GSTP1 in high-grade serous ovarian cancer (2023)

H&E image analysis pipeline for quantifying morphological features (2023)

Functional Homologous Recombination Assay on FFPE Specimens of Advanced High-Grade Serous Ovarian Cancer Predicts Clinical Outcomes (2023)

Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer (2022)

Optimized detection of homologous recombination deficiency improves the prediction of clinical outcomes in cancer (2022)

Effects of Wee1 inhibitor adavosertib on patient-derived high-grade serous ovarian cancer cells are multiple and independent of homologous recombination status (2022)

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability (2022)

A Subset of Secreted Proteins in Ascites Can Predict Platinum-Free Interval in Ovarian Cancer (2022)

Imaging of Tumor Hypoxia With F-18-EF5 PET/MRI in Cervical Cancer (2021)

Co-evolution of matrisome and adaptive adhesion dynamics drives ovarian cancer chemoresistance (2021)