Tuomas Borman

HoloFoodR: a statistical programming framework for holo-omics data integration workflows (2025)

Bioinformatics

Borman, Tuomas; Sannikov, Artur; Finn, Robert D; Limborg, Morten Tønsberg; Rogers, Alexander B; Kale, Varsha; Hanhineva, Kati; Lahti, Leo

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

iSEEtree: interactive explorer for hierarchical data (2025)

Bioinformatics Advances

Benedetti, Giulio; Seraidarian, Ely; Pralas, Theotime; Jeba, Akewak; Borman, Tuomas; Lahti, Leo

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Multi-omics time-series analysis in microbiome research: a systematic review (2025)

Briefings in Bioinformatics

Sherwani, Moiz Khan; Ruuskanen, Matti O.; Feldner-Busztin, Dylan; Nisantzis Firbas, Panos; Boza, Gergely; Móréh, Ágnes; Borman, Tuomas; Putu Erawijantari, Pande; Scheuring, István; Gopalakrishnan, Shyam; Lahti, Leo

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Fecal microbiota profiles of growing pigs and their relation to growth performance (2024)

PLoS ONE

König, Emilia; Beasley, Shea; Heponiemi, Paulina; Kivinen, Sanni; Räkköläinen, Jaakko; Salminen, Seppo; Collado, Maria Carmen; Borman, Tuomas; Lahti, Leo; Piirainen, Virpi; Valros, Anna; Heinonen, Mari

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Fewer culturable Lactobacillaceae species identified in faecal samples of pigs performing manipulative behaviour (2024)

Scientific Reports

König Emilia, Heponiemi Paulina, Kivinen Sanni, Räkköläinen Jaakko, Beasley Shea, Borman Tuomas, Collado Maria Carmen, Hukkinen Vilja, Junnila Jouni, Lahti Leo, Norring Marianna, Piirainen Virpi, Salminen Seppo, Heinonen Mari, Valros Anna

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

miaSim: an R/Bioconductor package to easily simulate microbial community dynamics (2023)

Methods in Ecology and Evolution

Gao Yu, Şimşek Yağmur, Gheysen Emma, Borman Tuomas, Li Yi, Lahti Leo, Faust Karoline, Garza Daniel Rios

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Tuomas

Borman

Contact

Links

Publications

Sort by:

HoloFoodR: a statistical programming framework for holo-omics data integration workflows (2025)

iSEEtree: interactive explorer for hierarchical data (2025)

Multi-omics time-series analysis in microbiome research: a systematic review (2025)

Fecal microbiota profiles of growing pigs and their relation to growth performance (2024)

Fewer culturable Lactobacillaceae species identified in faecal samples of pigs performing manipulative behaviour (2024)

miaSim: an R/Bioconductor package to easily simulate microbial community dynamics (2023)