Sini Junttila

Cell-connectivity-guided trajectory inference from single-cell data (2023)

Bioinformatics

Smolander Johannes, Junttila Sini, Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Elevated 18:0 lysophosphatidylcholine contributes to the development of pain in tissue injury (2023)

PAIN

Friston DA, Cuddihy J, Luiz JS, Truong AH, Ho L, Basra M, Santha P, Oszlacs O, Valente JD, Marczylo T, Junttila S, Laycock H, Collins D, Vizcaychipi M, Gyenesei A, Takats Z, Jancso G, Want E, Nagy I

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

COVID-19-specific transcriptomic signature detectable in blood across multiple cohorts (2022)

Frontiers in Genetics

Välikangas Tommi, Junttila Sini, Rytkönen Kalle T, Kukkonen-Macchi Anu, Suomi Tomi, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation (2022)

Frontiers in Immunology

Khan Mohd Moin, Khan Meraj Hasan, Kalim Ubaid Ullah, Khan Sofia, Junttila Sini, Paulin Niklas, Kong Lingjia, Rasool Omid, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Early DNA methylation changes in children developing beta cell autoimmunity at a young age (2022)

Diabetologia

Starskaia Inna, Laajala Essi, Grönroos Toni, Härkönen Taina, Junttila Sini, Kattelus Roosa, Kallionpää Henna, Laiho Asta, Suni Veronika, Tillmann Vallo, Lund Riikka, Elo Laura L. Lähdesmäki Harri, Knip Mikael, Kalim Ubaid Ullah, Lahesmaa Riitta

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Spectrum and Density of Gamma and X-ray Induced Mutations in a Non-Model Rice Cultivar (2022)

Plants

Jankowicz-Cieslak Joanna, Hofinger Bernhard J, Jarc Luka, Junttila Sini, Galik Bence, Gyenesei Attila, Ingelbrecht Ivan L, Till Bradley J

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Benchmarking methods for detecting differential states between conditions from multi-subject single-cell RNA-seq data (2022)

Briefings in Bioinformatics

Junttila Sini, Smolander Johannes, Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

A systematic comparison of FOSL1, FOSL2 and BATF-mediated transcriptional regulation during early human Th17 differentiation (2022)

Nucleic Acids Research

Shetty Ankitha, Tripathi Subhash Kumar, Junttila Sini, Buchacher Tanja, Biradar Rahual, Bhosale Santosh D, Envall Tapio, Laiho Asta, Moulder Robert, Rasool Omid, Galande Sanjeev, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Differential ATAC-seq and ChIP-seq peak detection using ROTS (2021)

NAR Genomics and Bioinformatics: Nucleic Acids Research Genomics and Bioinformatics

Faux Thomas, Rytkönen Kalle T., Mahmoudian Mehrad, Paulin Niklas, Junttila Sini, Laiho Asta, Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data (2021)

Bioinformatics

Smolander Johannes, Junttila Sini, Venäläinen Mikko S, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Publications

Sort by:

Cell-connectivity-guided trajectory inference from single-cell data (2023)

Elevated 18:0 lysophosphatidylcholine contributes to the development of pain in tissue injury (2023)

COVID-19-specific transcriptomic signature detectable in blood across multiple cohorts (2022)

Long Intergenic Noncoding RNA MIAT as a Regulator of Human Th17 Cell Differentiation (2022)

Early DNA methylation changes in children developing beta cell autoimmunity at a young age (2022)

Spectrum and Density of Gamma and X-ray Induced Mutations in a Non-Model Rice Cultivar (2022)

Benchmarking methods for detecting differential states between conditions from multi-subject single-cell RNA-seq data (2022)

A systematic comparison of FOSL1, FOSL2 and BATF-mediated transcriptional regulation during early human Th17 differentiation (2022)

Differential ATAC-seq and ChIP-seq peak detection using ROTS (2021)

ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data (2021)