Sini Junttila

scShaper: an ensemble method for fast and accurate linear trajectory inference from single-cell RNA-seq data (2021)

Bioinformatics

Smolander Johannes, Junttila Sini, Venäläinen Mikko S., Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Differential ATAC-seq and ChIP-seq peak detection using ROTS (2021)

NAR Genomics and Bioinformatics: Nucleic Acids Research Genomics and Bioinformatics

Faux Thomas, Rytkönen Kalle T., Mahmoudian Mehrad, Paulin Niklas, Junttila Sini, Laiho Asta, Elo Laura L.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data (2021)

Bioinformatics

Smolander Johannes, Junttila Sini, Venäläinen Mikko S, Elo Laura L

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Leptin and fractalkine: novel subcutaneous cytokines in burn injury (2020)

Disease Models and Mechanisms

Friston D, Junttila S, Lemes JBP, Laycock H, Torres-Perez JV, Want E, Gyenesei A, Nagy I

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Reproducibility-optimized detection of differential DNA methylation (2020)

Epigenomics

Veronika Suni, Fatemeh Seyednasrollah, Bishwa Ghimire, Sini Junttila, Asta Laiho, Laura L Elo

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Retene causes multifunctional transcriptomic changes in the heart of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) embryos (2016)

Environmental Toxicology and Pharmacology

Vehniainen ER, Bremer K, Scott JA, Junttila S, Laiho A, Gyenesei A, Hodson PV, Oikari AOJ

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Characterisation of Cladonia rangiferina transcriptome and genome, and the effects of dehydration and rehydration on its gene expression (2016)

Junttila Sini

(Artikkeliväitöskirja (G5))

Differential Promoter Methylation of Macrophage Genes Is Associated With Impaired Vascular Growth in Ischemic Muscles of Hyperlipidemic and Type 2 Diabetic Mice Genome-Wide Promoter Methylation Study (2015)

Circulation Research

Babu M, Devi TD, Makinen P, Kaikkonen M, Lesch HP, Junttila S, Laiho A, Ghimire B, Gyenesei A, Yla-Herttuala S

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

IRF4 Deficiency Leads to Altered BCR Signalling Revealed by Enhanced PI3K Pathway, Decreased SHIP Expression and Defected Cytoskeletal Responses (2015)

Scandinavian Journal of Immunology

Budzynska PM, Niemela M, Sarapulov AV, Kylaniemi MK, Nera KP, Junttila S, Laiho A, Mattila PK, Alinikula J, Lassila O

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Effect of ciprofloxacin exposure on DNA repair mechanisms in Campylobacter jejuni (2013)

Microbiology / Mikrobiologiya

Hyytiäinen H, Juntunen P, Scott T, Kytömäki L, Venho R, Laiho A, Junttila S, Gyenesei A, Revez J, Hänninen M

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Publications

Sort by:

scShaper: an ensemble method for fast and accurate linear trajectory inference from single-cell RNA-seq data (2021)

Differential ATAC-seq and ChIP-seq peak detection using ROTS (2021)

ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data (2021)

Leptin and fractalkine: novel subcutaneous cytokines in burn injury (2020)

Reproducibility-optimized detection of differential DNA methylation (2020)

Retene causes multifunctional transcriptomic changes in the heart of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) embryos (2016)

Characterisation of Cladonia rangiferina transcriptome and genome, and the effects of dehydration and rehydration on its gene expression (2016)

Differential Promoter Methylation of Macrophage Genes Is Associated With Impaired Vascular Growth in Ischemic Muscles of Hyperlipidemic and Type 2 Diabetic Mice Genome-Wide Promoter Methylation Study (2015)

IRF4 Deficiency Leads to Altered BCR Signalling Revealed by Enhanced PI3K Pathway, Decreased SHIP Expression and Defected Cytoskeletal Responses (2015)

Effect of ciprofloxacin exposure on DNA repair mechanisms in Campylobacter jejuni (2013)