Tiina
Sävilammi
Postdoctoral Researcher, Physiology and Genetics
PhD
FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome) research group studies the equine gut microbiome in disease and in health.
Areas of expertise
Next-generation sequencing data
bioinformatics
genomics
epigenomics
microbiomes
Linux user interface
programming with Java,Perl
R. Relational databases and Spring Boot Hibernate.
Research
I am currently benchmarking a novel phage-base method to accelerate sequencing library preparation step, and utilizing the method to study equine gut microbiota. The aim for the application is to study the functional and species composition changes in the microbiota in horses affected by chronic inflammatory disease (IBD).
Publications
The molecular mechanisms of rapid thermal adaptation in European grayling (2024)
(G5 Artikkeliväitöskirja)Gut Microbiota Profiling as a Promising Tool to Detect Equine Inflammatory Bowel Disease (IBD) (2024)
Animals
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Whole-genome Analysis Reveals Contrasting Relationships Among Nuclear and Mitochondrial Genomes Between Three Sympatric Bat Species (2023)
Genome Biology and Evolution
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Genetic-based evaluation of management units for sustainable vendace (Coregonus albula) fisheries in a large lake system (2022)
Fisheries Research
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Cytosine methylation patterns suggest a role of methylation in plastic and adaptive responses to temperature in European grayling (Thymallus thymallus) populations (2020)
Epigenetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Population Connectivity Predicts Vulnerability to White-Nose Syndrome in the Chilean Myotis (Myotis chiloensis)-A Genomics Approach (2020)
G3: genes, genomes, genetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
The Chromosome-Level Genome Assembly of European Grayling Reveals Aspects of a Unique Genome Evolution Process Within Salmonids (2019)
G3: genes, genomes, genetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Rapid, broad-scale gene expression evolution in experimentally harvested fish populations (2017)
Molecular Ecology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))