Tiina
Sävilammi
tutkijatohtori, fysiologia ja genetiikka
ekologia ja evoluutiobiologia
PhD
FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome) -tutkimusryhmä tutkii hevosen suolistomikrobiomia. www.hevosenmikrobiomitutkimus.fi
Linkit
Asiantuntijuusalueet
Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät
bioinformatiikka
genomiikka
epigenomiikka
mikrobiomit. Linux-käyttöjärjestelmä
ohjelmointikielet Java
Perl
R. Relaatiotiotokannat ja Spring Boot Hibernate.
Tutkimus
Tällä hetkellä tutkin uuden faagiavusteisen sekvensointikirjastojen tekomenetelmän suorituskykyä ja sovellan sitä hevosen suolistomikrobiston tutkimukseen. Soveltavan tutkimuksen tarkoituksena on selvittää, miten suolistomikrobiston funktiot ja lajisto muuttuu kroonisen suolistotulehduksen (IBD) seurauksena.
Julkaisut
Gut Microbiota Profiling as a Promising Tool to Detect Equine Inflammatory Bowel Disease (IBD) (2024)
Animals
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The molecular mechanisms of rapid thermal adaptation in European grayling (2024)
(G5 Artikkeliväitöskirja)Whole-genome Analysis Reveals Contrasting Relationships Among Nuclear and Mitochondrial Genomes Between Three Sympatric Bat Species (2023)
Genome Biology and Evolution
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Genetic-based evaluation of management units for sustainable vendace (Coregonus albula) fisheries in a large lake system (2022)
Fisheries Research
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Population Connectivity Predicts Vulnerability to White-Nose Syndrome in the Chilean Myotis (Myotis chiloensis)-A Genomics Approach (2020)
G3: genes, genomes, genetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Cytosine methylation patterns suggest a role of methylation in plastic and adaptive responses to temperature in European grayling (Thymallus thymallus) populations (2020)
Epigenetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
The Chromosome-Level Genome Assembly of European Grayling Reveals Aspects of a Unique Genome Evolution Process Within Salmonids (2019)
G3: genes, genomes, genetics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Rapid, broad-scale gene expression evolution in experimentally harvested fish populations (2017)
Molecular Ecology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))