
Farrokh
Mehryary
erikoistutkija, data-analytiikka
PhD in Computer Science
Contact
Julkaisut
The STRING database in 2023: protein-protein association networks and functional enrichment analyses for any sequenced genome of interest (2023)
Nucleic Acids Research
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Optimizing text mining methods for improving biomedical natural language processing (2022)
(Artikkeliväitöskirja (G5))Overview of DrugProt BioCreative VII track: quality evaluation and large scale text mining of drug-gene/protein relations (2021)
BioCreative
(Vertaisarvioimaton konferenssijulkaisu (B3))
Neural Network and Random Forest Models in Protein Function Prediction (2020)
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Entity-pair embeddings for improving relation extraction in the biomedical domain (2020)
European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning
(Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa (A4))
The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens (2019)
Genome Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Combining support vector machines and LSTM networks for chemical-protein relation extraction (2018)
BioCreative
(Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa (A4))
Data and systems for medication-related text classification and concept normalization from Twitter: insights from the Social Media Mining for Health (SMM4H)-2017 shared task (2018)
Journal of the American Medical Informatics Association
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
TurkuNLP Entry for Interactive Bio-ID Assignment (2018)
BioCreative
(Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa (A4))
Potent pairing: ensemble of long short-term memory networks and support vector machine for chemical-protein relation extraction (2018)
Database: The Journal of Biological Databases and Curation
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))