Jarmo
Niemi
dosentti, matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta
Ph.D.
Linkit
Asiantuntijuusalueet
Antibioottien biosynteesi
Streptomyces'in biologia
proteiinitutkimus
Biografia
Olen syntynyt Porissa 1958, valmistunut FK:ksi Turun yliopistosta 1983 ja suorittanut FT-tutkinnon 1998. Biokemian y.p. lehtoriksi minut nimitettiin 2005.
Olen naimisissa, ja minulla on 2 lasta.
Opetus
Olen jäänyt eläkkeelle lehtorin toimestani
Tutkimus
Olen työskennellyt antibioottien biosynteesin parissa ensin lääketehdas Leiraksessa ja sittemmin Turun yliopistossa.
Väittelin 1995 aiheesta "Hybrid
Anthracycline Antibiotics: Analysis and
Application
of Rhodomycin Biosynthetic Genes from Streptomyces purpurascens"
Tutkimustyöni on käsitellyt antibioottien biosynteesin molekyylibiologiaa, entsyymitutkimusta ja entsyymien rakennebiologiaa. Osallistun nykyään tutkimusryhmän "Antibiotic biosynthesis engineering".(http://abelab.utu.fi/) tutkimuksiin.
Julkaisut
Facultative predation expands the ecological repertoire of Streptomyces (2026)
mBio
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Metabolic engineering of doxorubicin biosynthesis through P450-redox partner optimization and structural analysis of DoxA (2026)
Nature Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Diverse Combinatorial Biosynthesis Strategies for C-H Functionalization of Anthracyclinones (2024)
ACS Synthetic Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Pseudouridine-Modifying Enzymes SapB and SapH Control Entry into the Pseudouridimycin Biosynthetic Pathway (2023)
ACS Chemical Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Differential regulation of undecylprodigiosin biosynthesis in the yeast-scavenging Streptomyces strain MBK6 (2021)
FEMS Microbiology Letters
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Characterization of C-nucleoside Antimicrobials from Streptomyces albus DSM 40763: Strepturidin is Pseudouridimycin (2019)
Scientific Reports
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Evolutionary Trajectories for the Functional Diversification of Anthracycline Methyltransferases (2019)
ACS Chemical Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Discovery of the Showdomycin Gene Cluster from Streptomyces showdoensis ATCC 15227 Yields Insight into the Biosynthetic Logic of C-Nucleoside Antibiotics (2017)
ACS Chemical Biology
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Divergent evolution of an atypical S-adenosyl-L-methionine-dependent monooxygenase involved in anthracycline biosynthesis (2015)
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Coordinate changes in gene expression and triacylglycerol composition in the developing seeds of oilseed rape (Brassica napus) and turnip rape (Brassica rapa) (2014)
Food Chemistry
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))