Markus toimii Turun yliopistossa laskentatoimen ja johdon ohjausjärjestelmien professorina sekä kauppakorkeakoulun dekaanina. Hänen tutkimusintressinsä kattavat laajasti johtamis- ja tietojärjestelmien teknisiä ja käyttäytymistieteellisiä aspekteja. Hän on julkaissut laajasti arvostetuissa tieteellisissä journaaleissa ja toimii useissa toimitustehtävissä (Associate Editor, Guest Editor, Editorial Board member, reviewer). Vuosina 1994-1995 hän toimi tohtorikoulutettavana Copenhagen Business Schoolissa ja vuosina 2005-2006 vierailevana professorina University of Technology Sydney’ssä. Markus toimii lukuisissa luottamustoimissa (mm. säätiöiden hallituksissa) ja tällä hetkellä myös Suomen kauppakorkeakoulut ry:n puheenjohtajana. Hän on toiminut myös asiantuntijana lukuisissa yritysten ja julkisen sektorin organisaatioiden kehitysprojekteissa sekä arvostettuna liikkeenjohdon kouluttajana Suomessa ja ulkomailla. Hänen harrastuksensa ovat urheilupainotteisia, talvella jääkiekko ja kesällä jalkapallo.