Olli
Pentikäinen
professori, biolääketieteen laitos
InFLAMES Lippulaiva
PhD
Links
Asiantuntijuusalueet
Tietokone-riippuvainen lääkeainekehitys
Molekyylimallinnus
Proteiinien rakenne-toiminta suhde
Proteiini-proteiini vuorovaikutus
Biografia
Koulutus:
FM (orgaaninen) kemia 1995 (Joensuun yliopisto)
FT Biokemia 2003 (Åbo Akademi)
Dosentti (Biokemia) 2005- (Turun yliopisto)
Vakanssit:
2017- Lääkeainekemian professori (Turun yliopisto) 8/2017
2006- Solu- ja molekyylibiologian Yliassistentti/Yliopistonlehtori (Jyväskylän yliopisto)
2015 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Innsbruck, Itävalta)
2005-2006 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Bristol, UK)
1999-2005 Tutkimuspäällikkö (FBD OY)
Tutkimus
Tutkimuksemme keskittyy uusien tehokkaiden lääkeaineiden etsimiseen sekä siihen liittyvien uusien menetelmien kehitykseen. Erityisesti aiemmin mahdottomina pidetyt syöpälääkekehityskohteet yhdessä lääkeaineiden riskiarvioinnin kanssa muodostavat tällä hetkellä tutkimuksemme pääpainoalueet.
Julkaisut
Oxazolidinones: Are they only good for the discovery of antibiotics? A worm's eye view (2023)
Journal of Molecular Structure
(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))
Computational Study on the Inhibitory Effect of Natural Compounds against the SARS-CoV-2 Proteins (2022)
Bioinorganic Chemistry and Applications
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Optimization of Cavity-Based Negative Images to Boost Docking Enrichment in Virtual Screening (2022)
Journal of Chemical Information and Modeling
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Ligand-Enhanced Negative Images Optimized for Docking Rescoring (2022)
International Journal of Molecular Sciences
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Rational design, optimization, and biological evaluation of novel α-Phosphonopropionic acids as covalent inhibitors of Rab geranylgeranyl transferase (2022)
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Sdfconf: A Novel, Flexible, and Robust Molecular Data Management Tool (2022)
Journal of Chemical Information and Modeling
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
Detection of binding sites on SARS-CoV-2 Spike protein receptor-binding domain by molecular dynamics simulations in mixed solvents (2021)
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))
A holistic view on c-Kit in cancer: Structure, signaling, pathophysiology and its inhibitors (2021)
BBA - Reviews on Cancer
(Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A2))
Negative Image-Based Screening: Rigid Docking Using Cavity Information (2021)
(Vertaisarvioitu artikkeli kokoomateoksessa (A3))Molecular docking and oxidation kinetics of 3-phenyl coumarin derivatives by human CYP2A13 (2021)
Xenobiotica
(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))