Riikka Lund

From maternal glucocorticoid and thyroid hormones to epigenetic regulation of offspring gene expression: An experimental study in a wild bird species (2023)

Evolutionary Applications

Hukkanen Mikaela, Hsu Bin-Yan, Cossin-Sevrin Nina, Crombecque Mélanie, Delaunay Axelle, Hollmen Lotta, Kaukonen Riina, Konki Mikko, Lund Riikka, Marciau Coline, Stier Antoine, Ruuskanen Suvi

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Permutation-based significance analysis reduces the type 1 error rate in bisulfite sequencing data analysis of human umbilical cord blood samples (2022)

Epigenetics

Laajala Essi, Halla-Aho Viivi, Grönroos Toni, Kalim Ubaid Ullah, Vähä-Mäkilä Mari, Nurmio Mirja, Kallionpää Henna, Lietzén Niina, Mykkänen Juha, Rasool Omid, Toppari Jorma, Oresic Matej, Knip Mikael, Lund Riikka, Lahesmaa Riitta, Lähdesmäki Harri

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

LuxRep: a technical replicate-aware method for bisulfite sequencing data analysis (2022)

BMC Bioinformatics

Malonzo Maia H, Halla-Aho Viivi, Konki Mikko, Lund Riikka J, Lähdesmäki Harri

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Umbilical cord blood DNA methylation in children who later develop type 1 diabetes (2022)

Diabetologia

Laajala Essi, Kalim Ubaid U, Grönroos Toni, Rasool Omid, Halla-aho Viivi, Konki Mikko, Kattelus Roosa, Mykkänen Juha, Nurmio Mirja, Vähä-Mäkilä Mari, Kallionpää Henna, Lietzen Niina, Ghimire Bishwa R, Laiho Asta, Hyöty Heikki, Elo Laura L, Ilonen Jorma, Knip Mikael, Lund Riikka J, Orešič Matej, Veijola Riitta, Lähdesmäki Harri, Toppari Jorma, Lahesmaa Riitta

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Early DNA methylation changes in children developing beta cell autoimmunity at a young age (2022)

Diabetologia

Starskaia Inna, Laajala Essi, Grönroos Toni, Härkönen Taina, Junttila Sini, Kattelus Roosa, Kallionpää Henna, Laiho Asta, Suni Veronika, Tillmann Vallo, Lund Riikka, Elo Laura L. Lähdesmäki Harri, Knip Mikael, Kalim Ubaid Ullah, Lahesmaa Riitta

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Placental DNA methylation marks are associated with maternal depressive symptoms during early pregnancy (2021)

Neurobiology of Stress

Lund Riikka, Kyläniemi Minna, Pettersson Nina, Kaukonen Riina, Konki Mikko, Scheinin Noora, Karlsson Linnea, Karlsson Hasse, Ekholm Eeva

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Evaluation of tools for identifying large copy number variations from ultra-low-coverage whole-genome sequencing data (2021)

BMC Genomics

Smolander Johannes, Khan Sofia, Singaravelu Kalaimathy, Kauko Leni, Lund Riikka J., Laiho Asta, L. Elo Laura

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Analysis of H3K4me3 and H3K27me3 bivalent promotors in HER2+ breast cancer cell lines reveals variations depending on estrogen receptor status and significantly correlates with gene expression (2020)

BMC Medical Genomics

Damien Kaukonen, Riina Kaukonen, Lélia Polit, Bryan T Hennessy, Riikka Lund, Stephen F Madden

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Single cell characterization of B-lymphoid differentiation and leukemic cell states during chemotherapy in ETV6-RUNX1-positive pediatric leukemia identifies drug-targetable transcription factor activities (2020)

Genome Medicine

Juha Mehtonen, Susanna Teppo, Mari Lahnalampi, Aleksi Kokko, Riina Kaukonen, Laura Oksa, Maria Bouvy-Liivrand, Alena Malyukova, Artturi Mäkinen, Saara Laukkanen, Petri I. Mäkinen, Samuli Rounioja, Pekka Ruusuvuori, Olle Sangfelt, Riikka Lund, Tapio Lönnberg, Olli Lohi, Merja Heinäniemi

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Plasma cell-free DNA methylation marks for episodic memory impairment: a pilot twin study (2020)

Scientific Reports

M. Konki, N. Lindgren, M. Kyläniemi, R. Venho, E. Laajala, B. Ghimire, R. Lahesmaa, J. Kaprio, J. O. Rinne, R. J. Lund

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Links

Asiantuntijuusalueet

Opetus

Julkaisut

Järjestä:

From maternal glucocorticoid and thyroid hormones to epigenetic regulation of offspring gene expression: An experimental study in a wild bird species (2023)

Permutation-based significance analysis reduces the type 1 error rate in bisulfite sequencing data analysis of human umbilical cord blood samples (2022)

LuxRep: a technical replicate-aware method for bisulfite sequencing data analysis (2022)

Umbilical cord blood DNA methylation in children who later develop type 1 diabetes (2022)

Early DNA methylation changes in children developing beta cell autoimmunity at a young age (2022)

Placental DNA methylation marks are associated with maternal depressive symptoms during early pregnancy (2021)

Evaluation of tools for identifying large copy number variations from ultra-low-coverage whole-genome sequencing data (2021)

Analysis of H3K4me3 and H3K27me3 bivalent promotors in HER2+ breast cancer cell lines reveals variations depending on estrogen receptor status and significantly correlates with gene expression (2020)

Single cell characterization of B-lymphoid differentiation and leukemic cell states during chemotherapy in ETV6-RUNX1-positive pediatric leukemia identifies drug-targetable transcription factor activities (2020)

Plasma cell-free DNA methylation marks for episodic memory impairment: a pilot twin study (2020)