Johdatus bioinformatiikkaan
Johdatus bioinformatiikkaan -kurssi johdattaa opiskelijat bioinformatiikan keskeisiin käsitteisiin ja menetelmiin. Kurssilla perehdytään DNA- ja proteiinitietokantoihin, sekvenssien vertailuun ja proteiinien 3D-rakenteiden tarkasteluun. Käytännön taitoja harjoitellaan verkkotyökaluilla ja harjoitustehtävillä.
Kurssi sopii kaikille bioinformatiikasta kiinnostuneille (ei esitietovaatimuksia)..
Kurssin sisältö:
- Bioinformatiikan perusteet ja sovellusalueet
- DNA- ja proteiinisekvenssit ja niiden tietokannat
- Proteiinirakenteet, DNA-sekvensointi
- Sekvenssien vertailumenetelmät
- AlphaFold-tekoälymenetelmä
Tavoitteena on, että opintojakson suoritettuaan opiskelija osaa kuvata bioinformatiikassa käytettävän datan ja analyysimenetelmät, tuntee keskeisimmät DNA- ja proteiinitietokannat ja osaa hakea niistä tietoa. Opiskelija osaa vertailla sekvenssejä, avata proteiinien 3D-rakenteita verkkotyökaluilla sekä selittää AlphaFold-menetelmän merkityksen proteiinitutkimukselle.
Kurssi toteutetaan verkko-opetuksena. Luentokalvot ja materiaali Moodlessa, lisäksi linkit englanninkielisiin verkkosivuihin ja videoihin. Lisäksi käytetään sekvenssien vertailu- ja proteiinirakenteen visualisointityökaluja (verkkotyökaluja). Kurssin tentti tehdään Exam-tenttinä.
Kurssin suorituksesta on mahdollista saada digitaalinen suoritusmerkki..