Manu
Tamminen
dosentti, biologian laitos
akatemiatutkija, fysiologia ja genetiikka
PhD, Docent
Ota yhteyttä
Asiantuntijuusalueet
Molekyylibiologia
Bioinformatiikka
Mikrobigenetiikka
Mikrobiekologia
Biografia
- FM, Turun yliopisto, 2002
- FT, Helsingin yliopisto, 2011
- Tutkijatohtori, MIT, 2011-2013
- Tutkijatohtori, ETH Zürich, 2014-2017
- Dosentti, Turun yliopisto, 2017
- Yliopistonlehtori, Turun yliopisto, 2017-
Opetus
- SOMO1021 - Genetiikan jatkoluennot (2018)
- FYGE2242 - Mikrobigenetiikan laboratoriotyöt (2018)
- BIOL1301 - Genetiikan perusteet (2018)
- FYGE 4031 - Genetiikan menetelmäopinnot II (2018)
- BIOL3050 - Bioinformatiikkaa biologeille (2019)
- BIOL3200 - Kandidaattiseminaarit (2019)
- BIOL1301 - Genetiikan perusteet (2019)
- FYGE 4031 - Genetiikan menetelmäopinnot II (2019)
Tutkimus
- Bakteereiden ja pienten eukaryoottien yksisolugenomiikka
- Antibioottiresistenssigeenien horisontaalinen siirtyminen
- NGS:n kvantitatiiviset sovellukset
Julkaisut
Evaluation of Bridge Capture technology for mutation profiling in liquid biopsies of metastatic colorectal cancer patients (2025)
Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Polyacrylamide bead split-pool method for microbial community analysis (2025)
bioRxiv
(O2 Muu julkaisu )
Cellular heterogeneity in metabolism and associated microbiome of a non-model phytoflagellate (2025)
ISME Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glyphosate and phosphate treatments in soil differentially affect crop microbiomes depending on species, tissue and growth stage (2025)
Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
High-Throughput Multiplex Detection of Antibiotic-Resistant Genes and Virulence Factors in Escherichia coli Using Digital Multiplex Ligation Assay (2025)
Journal of Molecular Diagnostics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The role of early life factors and green living environment in the development of gut microbiota in infancy : Population-based cohort study (2024)
Environment International
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Complete genome sequences of 30 bacterial species from a synthetic community (2024)
Microbiology resource announcements
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glyphosate residues in soil and phosphate fertilizer affect foliar endophytic microbial community composition and phytohormone levels in potato (2024)
Phytobiomes journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Foundation species stabilize an alternative eutrophic state in nutrient disturbed ponds via selection on microbial community (2024)
Frontiers in Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Molecular Characterisation of Faecal Bacterial Assemblages Among Four Species of Syntopic Odonates (2023)
Microbial Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )