Tomi Suomi

Therapeutic TG2 inhibition reverses systemic multiomic dysregulation in celiac disease (2026)

BMC Medicine

Dotsenko, Valeriia; Le Hana, Hien; Rajić, Sonja; Moulder, Robert; Kettunen, Jalmari; Hirvonen, M. Karoliina; Dickens, Alex M; Hyötyläinen, Tuulia; Tewes, Bernhard; Zimmermann, Timo; Mohrbacher, Ralf; Suomi, Tomi; Lehtimäki, Terho; Lahesmaa, Riitta; Orešič, Matej; Elo, Laura L.; Raitoharju, Emma; Schuppan, Detlef; Mäki, Markku; Viiri, Keijo; on behalf of the CEC-3 Investigators

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Complete Data Analysis Workflow for Quantitative DIA Mass Spectrometry Using Nextflow (2026)

Journal of Proteome Research

Perk, Mats; Pietilä, Sami; Välikangas, Tommi; Balint, Balazs; Suomi, Tomi; Elo, Laura L.

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research (2026)

Bioinformatics

Lindén, Markus; Zúñiga Norman, Sebastián I.; Välikangas, Tommi; Junttila, Sini; Suomi, Tomi; Rytkönen, Kalle T; Elo, Laura L.

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Joint modeling of longitudinal and time‐to‐event data for dynamic disease risk prediction using proteomics (2026)

Protein Science

Lindén, Markus; Ammunét, Tea; Välikangas, Tommi; Elo, Laura L.; Suomi, Tomi

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Longitudinal pathway analysis using structural information with case studies in early type 1 diabetes (2025)

Scientific Reports

Jaakkola, Maria K.; Kukkonen-Macchi, Anu; Suomi, Tomi; Elo, Laura L.

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Metaproteomics Beyond Databases: Addressing the Challenges and Potentials of De Novo Sequencing (2025)

Proteomics

van den Bossche, Tim; Beslic, Denis; van Puyenbroeck, Sam; Suomi, Tomi; Holstein, Tanja; Martens, Lennart; Elo, Laura L.; Muth, Thilo

(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)

Proteomic profiling reveals alterations in metabolic and cellular pathways in severe obesity and following metabolic bariatric surgery (2025)

American Journal of Physiology : Endocrinology and Metabolism

Dadson, Prince; Honka, Miikka-Juhani; Suomi, Tomi; Haridas, P. A. Nidhina; Rokka, Anne; Palani, Senthil; Goltseva, Elena; Wang, Ning; Roivainen, Anne; Salminen, Paulina; James, Peter; Olkkonen, Vesa M.; Elo, Laura L.; Nuutila, Pirjo

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Characterization of Visceral Adipose Tissue Proteome Reveals Metabolic Changes and Inflammatory Signatures in Severe Obesity (2025)

Obesity

Dadson, Prince; Honka, Miikka‐Juhani; Suomi, Tomi; Rokka, Anne; Kauhanen, Saila; Salminen, Paulina; Helmiö, Mika; James, Peter; Elo, Laura L.; Olkkonen, Vesa M.; Nuutila Pirjo

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

CellRomeR: an R package for clustering cell migration phenotypes from microscopy data (2025)

Bioinformatics Advances

Kleino, Iivari; Perk, Mats; Sousa, António G G; Linden, Markus; Mathlin, Julia; Giesel, Daniel; Frolovaite, Paulina; Pietilä, Sami; Junttila, Sini; Suomi, Tomi; Elo, Laura L

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Targeted serum proteomics of longitudinal samples from newly diagnosed youth with type 1 diabetes affirms markers of disease (2025)

Diabetologia

Moulder, Robert; Hirvonen, M. Karoliina; Valikangas, Tommi; Suomi, Tomi; Overbergh, Lut; Peakman, Mark; Brunak, Soren; Mathieu, Chantal; Knip, Mikael; Elo, Laura L.; Lahesmaa, Riitta

(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )

Tomi

Suomi

Ota yhteyttä

Linkit

Julkaisut

Järjestä:

Therapeutic TG2 inhibition reverses systemic multiomic dysregulation in celiac disease (2026)

Complete Data Analysis Workflow for Quantitative DIA Mass Spectrometry Using Nextflow (2026)

REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research (2026)

Joint modeling of longitudinal and time‐to‐event data for dynamic disease risk prediction using proteomics (2026)

Longitudinal pathway analysis using structural information with case studies in early type 1 diabetes (2025)

Metaproteomics Beyond Databases: Addressing the Challenges and Potentials of De Novo Sequencing (2025)

Proteomic profiling reveals alterations in metabolic and cellular pathways in severe obesity and following metabolic bariatric surgery (2025)

Characterization of Visceral Adipose Tissue Proteome Reveals Metabolic Changes and Inflammatory Signatures in Severe Obesity (2025)

CellRomeR: an R package for clustering cell migration phenotypes from microscopy data (2025)

Targeted serum proteomics of longitudinal samples from newly diagnosed youth with type 1 diabetes affirms markers of disease (2025)