Tero Aittokallio

OSCAR: Optimal subset cardinality regression using the L0-pseudonorm with applications to prognostic modelling of prostate cancer (2023)

Halkola Anni S., Joki Kaisa, Mirtti Tuomas, Mäkelä Marko M., Aittokallio Tero, Laajala Teemu D.

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Tumor microenvironment as a metapopulation model: The effects of angiogenesis, emigration and treatment modalities (2022)

Journal of Theoretical Biology

Halkola Anni S, Aittokallio Tero, Parvinen Kalle

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Target-specific compound selectivity for multi-target drug discovery and repurposing (2022)

Frontiers in Pharmacology

Wang Tianduanyi, Pulkkinen Otto I., Aittokallio Tero

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

High intratumoral dihydrotestosterone is associated with antiandrogen resistance in VCaP prostate cancer xenografts in castrated mice (2022)

iScience

Huhtaniemi Riikka, Sipilä Petra, Junnila Arttu, Oksala Riikka, Knuuttila Matias, Mehmood Arfa, Aho Eija, Laajala Teemu D., Aittokallio Tero, Laiho Asta, Elo Laura, Ohlsson Claes, Thulin Malin H., Kallio Pekka, Mäkelä Sari, Mustonen Mika V.J., Poutanen Matti

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Modeling drug combination effects via latent tensor reconstruction (2021)

Wang Tianduanyi, Szedmak Sandor,Wang Haishan, Aittokallio Tero, Pahikkala Tapio, Cichonska Anna,Rousu Juho

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Multi-modal meta-analysis of cancer cell line omics profiles identifies ECHDC1 as a novel breast tumor suppressor (2021)

Molecular Systems Biology

Jaiswal Alok, Gautam Prson, Pietilä Elina A, Timonen Sanna, Nordström Nora, Akimov Yevhen, Sipari Nina, Tanoli Ziaurrehman, Fleischer Thomas, Lehti Kaisa, Wennerberg Krister, Aittokallio Tero

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Bayesian multi-source regression and monocyte-associated gene expression predict BCL-2 inhibitor resistance in acute myeloid leukemia (2021)

npj Precision Oncology

White Brian S., Khan Suleiman A., Mason Mike J., Ammad-ud-din Muhammad, Potdar Swapnil, Malani Disha, Kuusanmäki Heikki, Druker Brian J., Heckman Caroline, Kallioniemi Olli, Kurtz Stephen E., Porkka Kimmo, Tognon Cristina E., Tyner Jeffrey W., Aittokallio Tero, Wennerberg Krister, Guinney Justin

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Crowdsourced mapping of unexplored target space of kinase inhibitors (2021)

Nature Communications

Cichońska Anna, Ravikumar Balaguru, Allaway Robert J., Wan Fangping, Park Sungjoon, Isayev Olexandr, Li Shuya, Mason Michael, Lamb Andrew, Tanoli Ziaurrehman, Jeon Minji, Kim Sunkyu, Popova Mariya, Capuzzi Stephen, Zeng Jianyang, Dang Kristen, Koytiger Gregory, Kang Jaewoo, Wells Carrow I., Willson Timothy M.; The IDG-DREAM Drug-Kinase Binding Prediction Challenge Consortium, Oprea Tudor I., Schlessinger Avner, Drewry David H., Stolovitzky Gustavo, Wennerberg Krister, Guinney Justin, Aittokallio Tero

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Cost-effective survival prediction for patients with advanced prostate cancer using clinical trial and real-world hospital registry datasets (2020)

International Journal of Medical Informatics

Mika Murtojärvi, Anni S. Halkola, Antti Airola, Teemu D. Laajala, Tuomas Mirtti, Tero Aittokallio, Tapio Pahikkala

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

RUNX1 mutations in blast-phase chronic myeloid leukemia associate with distinct phenotypes, transcriptional profiles, and drug responses (2020)

Leukemia

Shady Adnan Awad, Olli Dufva, Aleksandr Ianevski, Bishwa Ghimire, Jan Koski, Pilvi Maliniemi, Daniel Thomson, Andreas Schreiber, Caroline A. Heckman, Perttu Koskenvesa, Matti Korhonen, Kimmo Porkka, Susan Branford, Tero Aittokallio, Matti Kankainen, Satu Mustjoki

(Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tai data-artikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä (A1))

Contact

Links

Julkaisut

Järjestä:

OSCAR: Optimal subset cardinality regression using the L0-pseudonorm with applications to prognostic modelling of prostate cancer (2023)

Tumor microenvironment as a metapopulation model: The effects of angiogenesis, emigration and treatment modalities (2022)

Target-specific compound selectivity for multi-target drug discovery and repurposing (2022)

High intratumoral dihydrotestosterone is associated with antiandrogen resistance in VCaP prostate cancer xenografts in castrated mice (2022)

Modeling drug combination effects via latent tensor reconstruction (2021)

Multi-modal meta-analysis of cancer cell line omics profiles identifies ECHDC1 as a novel breast tumor suppressor (2021)

Bayesian multi-source regression and monocyte-associated gene expression predict BCL-2 inhibitor resistance in acute myeloid leukemia (2021)

Crowdsourced mapping of unexplored target space of kinase inhibitors (2021)

Cost-effective survival prediction for patients with advanced prostate cancer using clinical trial and real-world hospital registry datasets (2020)

RUNX1 mutations in blast-phase chronic myeloid leukemia associate with distinct phenotypes, transcriptional profiles, and drug responses (2020)